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Transcriptómica: RNA-Seq
En Era7 Bioinformatics ofrecemos los siguientes servicios en transcriptómica:
- RNA-seq en bacterias
- RNA-seq dual
- RNA-seq para organismos no modelo
- RNA-seq para organismos modelo
 
- RNA-seq para Bacteria: desde la expresión génica de un clon a la Metatranscriptómica

RNA-seq está siendo cada vez más usado para explorar la expresión génica en bacterias, para conseguir información sobre el transcriptoma de un clon específico, de una comunidad bacteriana reducida o sobre el meta-transcriptoma de una comunidad bacteriana compleja.

- RNA-Seq Dual: descifrando las relaciones Huésped-Patógeno

Es un enfoque reciente, muy potente y útil para investigar las relaciones entre huésped y patógeno. Esta estrategia es posible gracias al alto rendimiento de las tecnologías de Next Generation Sequencing. NGS permite secuenciar el RNA de ambos, el huésped y el patógeno. De esta forma pueden descubrirse interacciones desconocidas entre el patógeno y el huésped.

- RNA-Seq para organismos no-modelo: una perspectiva única de los transcriptomas de novo

Un análisis rápido y completo de los datos del transcriptoma que no necesita de genoma de referencia: caracterización, anotación funcional, cuantificación de la expresión génica y detección de genes expresados de forma diferencial. La secuenciación Next-Gen de los transcriptomas puede ser una primera estrategia que nos permite obtener conocimiento sobre los exomas de genomas desconocidos.

- RNA-Seq para organismos modelo: con los más avanzados pipelines

RNA-Seq es la nueva alternativa a los microarrays para analizar la expresión géica obteniendo un rápido perfil de tu transcriptoma y permitiendo conocer en profundidad aspectos específicos como:

- Análisis de los sitios de splicing para la expresión de isoformas
- RNAs reguladores (smallRNAs, microRNAs, diferentes tipos de ncRNA)
- Cuantificación de la expresión génica
- Análisis de la expresión diferencial entre distintas muestras
 
 
 
 
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