Secuenciar para diagnosticar antes: cómo la biotecnología puede ayudar a acortar la odisea diagnóstica de los pacientes con enfermedades raras

Existen más de 7.000 enfermedades raras conocidas que afectan a más de 300 millones de personas en todo el mundo. En España, más de tres millones de personas conviven con una enfermedad rara. Ante la magnitud de este resto, se requieren esfuerzos continuos para acelerar un diagnóstico temprano y preciso para los pacientes. “A pesar de todos los avances logrados, las desigualdades de acceso siguen siendo una barrera clave, ya que la posibilidad de obtener un diagnóstico puede estar vinculada a factores como la localización geográfica, la situación socioeconómica o la disponibilidad de infraestructuras sanitarias especializadas a nivel local. Como resultado, muchos pacientes permanecen sin diagnosticar o reciben diagnósticos erróneos durante años", explica Marco Cappelletti, General Manager para MED, Latam y Central Europe en Illumina.

Cappelletti señala en la entrevista que una persona que vive con una enfermedad rara "tarda unos cinco años en recibir un diagnóstico, y un 20% de los pacientes espera más de una década para obtener una respuesta precisa". Un proceso tortuoso —conocido como la "odisea diagnóstica"— que no solo retrasa el acceso a la atención y tratamientos adecuados, sino que también permite la progresión de la enfermedad y "supone una considerable carga emocional, social y económica sobre los pacientes, sus familias y cuidadores". En este contexto, seguir abordando las desigualdades en el acceso a tecnologías diagnósticas avanzadas y reducir el número de personas sin diagnóstico “es esencial para mejorar los resultados en salud y poner fin a la odisea diagnóstica a la que siguen enfrentándose millones de personas que viven con una enfermedad rara”.

Infancia y enfermedades raras: la urgencia de llegar a tiempo

En la población pediátrica, el diagnóstico precoz es especialmente crucial, ya que alrededor del 80% de las enfermedades raras son de origen genético y alrededor del 70% se manifiestan en la infancia. Detectarlas de forma temprana permite prevenir o ralentizar su progresión, reducir la mortalidad y morbilidad infantil y facilitar el acceso a una gestión clínica adecuada y a terapias dirigidas, como explica Cappelletti. Además, reduce la incertidumbre y facilita la planificación asistencial adaptada a las necesidades del niño o la niña y de su familia.

Por el contrario, los retrasos diagnósticos tienen un impacto profundo: el 30% de los niños con una enfermedad rara mueren antes de los cinco años. No diagnosticar favorece la progresión de la enfermedad, puede conducir a circuitos de atención inadecuados y genera una carga emocional, social y económica significativa para las familias.

Biotecnología y secuenciación genómica: una nueva era diagnóstica

Las biotecnologías se han convertido en un pilar clave para comprender mejor las enfermedades raras, especialmente a través del enfoque de la secuenciación genómica. En un contexto en el que la mayoría de estas patologías tienen un origen genético, herramientas como la secuenciación del genoma completo (WGS) están llamadas a transformar el diagnóstico y la práctica clínica, acortando los tiempos y mejorando la precisión.

El diagnóstico molecular precoz y la promoción del cribado genómico neonatal son elementos clave. En España, iniciativas como CRINGENES y GenBorn, y a nivel europeo Screen4Care – dentro del Consorcio Internacional de Cribado Neonatal – buscan ampliar la detección precoz para facilitar un acceso más temprano y equitativo a la atención pediátrica personalizada y reducir la odisea diagnóstica.

En el caso específico de la secuenciación del genoma completo, hablamos de una herramienta integral que permite analizar el genoma humano en una sola prueba, a diferencia de otras técnicas. Esto facilita la identificación de múltiples variantes genéticas responsables de enfermedades raras y ha demostrado un alto rendimiento diagnóstico, además de ser rentable, especialmente cuando se incorpora temprano en el proceso de atención. Su impacto es especialmente relevante en recién nacidos y pacientes pediátricos en estado crítico, donde un diagnóstico rápido puede ser decisivo.

En España, proyectos como Baby Lynx – impulsados por el Instituto de Salud Carlos III y apoyados por Illumina – están generando evidencia sobre el valor clínico, diagnóstico y económico de incorporar WGS rápido en unidades de cuidados intensivos neonatales y pediátricos, con el objetivo de establecer un modelo nacional de referencia.

Desde un punto de vista clínico, la WGS permite aumentar el rendimiento diagnóstico, reducir costes incrementales y facilitar el inicio temprano del manejo específico de la afección. En comparación con los enfoques secuenciales basados en paneles o incluso en la secuenciación del exoma, la WGS evita pruebas repetidas y procedimientos redundantes (consultar bibliografía al final de la noticia). Su incorporación "representa un paso clave para garantizar diagnósticos genómicos más tempranos y precisos" y contribuye a poner fin a la odisea diagnóstica.

En este contexto, España está creando positivamente las condiciones para traducir los beneficios de la WGS en el estándar de atención para pacientes con enfermedades raras, aunque aún no esté establecida una implementación clínica sistemática. Iniciativas como IMPaCT-Genómica, el Programa de Enfermedades Raras No Diagnosticadas (ENoD), la red UNICAS o el proyecto SiGenES buscan promover la implementación coordinada, la interoperabilidad y la gobernanza de datos, conectando hospitales con centros de secuenciación y reforzando un modelo en el que los datos viajan en lugar del paciente. Sin embargo, el uso de la WGS sigue siendo mayoritariamente centrado en el campo de la investigación y no se ha integrado de forma consistente en la cartera común de servicios del Sistema Nacional de Salud, lo que pone de manifiesto la necesidad de pasar de pilotos a la adopción del SNS. Por tanto, el desarrollo de estándares clínicos armonizados y mecanismos específicos de financiación sigue siendo un paso clave y destacado. 

Avances europeos: modelos de financiación y acceso

A nivel europeo, países como Dinamarca, Inglaterra y Suecia ya cuentan con mecanismos de financiación regular para la WGS para determinadas indicaciones, mientras que otros —como Francia o Alemania— han habilitado modelos específicos o programas piloto que facilitan el acceso en el ámbito enfermedades raras. Estas experiencias refuerzan la viabilidad de su integración, siempre que vaya acompañada de financiación basada en el valor, refuerzo de infraestructuras, formación profesional y participación activa de los pacientes.

Hoy en día, los principales retos ya no son tecnológicos —los tiempos de secuenciación pueden ser inferiores a 24 horas bajo ciertas condiciones— sino organizativos y estructurales: derivación temprana a centros de expertos, la capacidad del sistema, la formación, la definición de circuitos asistenciales y la inversión sostenida en infraestructuras de datos robustas que garanticen una gestión segura e interoperable.

De cara al futuro, la adopción equitativa de la WGS como estándar asistencial podría reducir los retrasos diagnósticos, optimizar recursos y mejorar los resultados en etapas críticas del desarrollo infantil. También integrado en los programas de cribado neonatal, permitiría identificar determinadas patologías desde el nacimiento y actuar de forma más temprana. Además, los grandes volúmenes de datos generados no solo proporcionan información precisa para cada paciente, sino que también impulsan nuevos descubrimientos científicos y el desarrollo de terapias, en línea con la Organización Mundial de la Salud y su reconocimiento de las enfermedades raras como una prioridad salud pública global.

En palabras de Cappelletti, aprovechar la WGS "puede contribuir a poner fin a la odisea diagnóstica" y permitir que los pacientes reciban la atención adecuada en el momento adecuado, evitando ineficiencias derivadas de procesos prolongados y pruebas repetidas. Iniciativas como el Proyecto WORD también señalan que su incorporación puede aumentar el rendimiento diagnóstico y reducir costes incrementales, mejorando la trayectoria asistencial.

La secuenciación del genoma completo se presenta como un ejemplo tangible de cómo la innovación biotecnológica puede transformar los resultados de los pacientes y apoyar la práctica clínica: diagnosticar antes no solo transforma vidas, sino que también contribuye a un sistema sanitario más eficiente, equitativo y sostenible. Convertir este potencial en realidad dependerá ahora de un compromiso firme con su integración como estándar de atención.

MARCO CAPPELLETTI, GENERAL MANAGER PARA MED, LATAM Y CENTRAL EUROPE EN ILLUMINA

•  Proyecto piloto de 100.000 genomas sobre el diagnóstico de enfermedades raras en la atención sanitaria, informe preliminar  https://www.nejm.org/doi/pdf/10.1056/NEJMoa2035790?articleTools=true 
• Stranneheim, H., Lagerstedt-Robinson, K., Magnusson, M. et al. Integración de la secuenciación del genoma completo en un entorno sanitario: altas tasas diagnósticas en múltiples entidades clínicas en 3219 pacientes con enfermedades raras. Medicina Genoma 13, 40 (2021). https://doi.org/10.1186/s13073-021-00855-5 
• Souche E et al. Recomendaciones para la secuenciación del genoma completo en diagnósticos de enfermedades raras [publicado en línea antes de la publicación impresa, 16 de mayo de 2022]. Eur J Hum Genet. 2022; 10.1038/s41431-022-01113-x. doi:10.1038/s41431-022-01113-x 
• Nurchis MC, Riccardi MT, Radio FC, et al. Beneficio neto incremental de la secuenciación del genoma completo en recién nacidos y niños con sospecha de trastornos genéticos: revisión sistemática y metaanálisis de la evidencia de coste-efectividad. Política de Salud. abril de 2022; 126(4):337-345. doi:10.1016/j.healthpol.2022.03.001
• Incerti D, Xu XM, Chou JW, Gonzaludo N, Belmont JW, Schroeder BE. Rentabilidad de la secuenciación genómica para el diagnóstico de pacientes con enfermedades genéticas raras no diagnosticadas. Genet Med. 17 de noviembre de 2021; doi:10.1016/j.gim.2021.08.015
• Nurchis MC, Radio FC, Salmasi L, entre otros. Coste-efectividad de la secuenciación del genoma completo frente a la secuenciación del exoma completo en niños con sospecha de trastornos genéticos. JAMA Netw Open. 2024; 7(1):e2353514. doi:10.1001/jamanetworkopen.2023.53514
• Yeung A, Tan NB, Tan TY, Stark Z, Brown N, Hunter MF, Delatycki M, Stutterd C, Savarirayan R, Mcgillivray G, Stapleton R, Kumble S, Downie L, Regan M, Lunke S, Chong B, Phelan D, Brett GR, Jarmolowicz A, Prawer Y, Valente G, Smagarinsky Y, Martyn M, McEwan C, Goranitis I, Gaff C, White SM. Análisis de coste-efectividad de la secuenciación genómica en una cohorte prospectiva frente a la histórica de pacientes pediátricos complejos. Genet Med. 2020 diciembre; 22(12):1986-1993
• Lavelle TA, Feng X, Keisler M, Cohen JT, Neumann PJ, Prichard D, Schroeder BE, Salyakina D, Espinal PS, Weidner SB, Maron JL. Coste-efectividad de la secuenciación del exoma y genoma en niños con condiciones raras y no diagnosticadas. Genet Med. junio 2022; 24(6):1349-1361
• Lucca, C., Rosina, E., Pezzani, L., Piazzolla, D., Spaccini, L., Scatigno, A., Gasperini, S., Pezzoli, L., Cereda, A., Milani, D., Cattaneo, E., Cavallari, U., Frigeni, M., Marchetti, D., Daolio, C., Giordano, L., Bellini, M., Goisis, L., Mongodi, C., Tonduti, D., ... Iascone, M. (2025). Secuenciación de genoma completo de primer nivel frente a trío de último nivel para el diagnóstico de enfermedades raras de inicio pediátrico. Genética clínica, 108(4), 412–421. https://doi.org/10.1111/cge.14760