“El microbioma es un concepto bastante reciente por lo que todavía estamos en una etapa de pleno discovery”

A lo largo de la última década el término “microbioma” ha ido ganando popularidad como consecuencia de los avances científicos que se han producido, y que han puesto de relieve el importante papel que juega en la salud humana y animal. Precisamente, el microbioma es una de las tecnologías que posicionan a la biotecnología como una deep tech que está transformando el mundo.

El National Human Genome Research Institute define el microbioma como “la comunidad de microorganismos (como hongos, bacterias y virus) que existen en un entorno en particular”. En el caso de los seres humanos, este término se emplea con frecuencia para describir los microorganismos que “viven en o sobre una zona particular del cuerpo, como la piel o el tracto gastrointestinal”. Hablamos de grupos de microorganismos que son dinámicos y que cambian en respuesta a múltiples factores ambientales. 

Con motivo de la celebración este 27 de junio del Día Mundial del Microbioma hemos entrevistado a Juan Basterra, CEO de Mikrobiomik, compañía biofarmacéutica nacida para la investigación, desarrollo, producción y comercialización a través de terceros, de medicamentos basados en el microbioma humano. Fundada en 2018, MIKROBIOMIK aspira a ser la primera compañía mundial que comercialice en la Unión Europea el primer medicamento biológico basado en microbiota intestinal en la indicación de recurrencia por Clostridium difficile, a través de la administración de MBK-01 (4 cápsulas de microbiota fecal liofilizada) en una sola toma.

AseBio. ¿Qué es la microbiota y qué es el microbioma? 

Juan Basterra. La microbiota es el ecosistema de microorganismos, bacterias principalmente, aunque también virus, hongos y arqueas, que existen en una zona determinada de nuestro organismo, particularmente en el intestino humano. Si, además, sumamos a los microorganismos comentados su material genético, estaríamos hablando del microbioma. 

AseBio. La evidencia científica que relaciona el microbioma humano con múltiples aspectos de nuestra salud es creciente. ¿Hasta qué punto influye el microbioma en esta? 

Juan Basterra. El microbioma es un concepto bastante reciente que no tiene más de 10 años, por lo que todavía estamos en una etapa y, lo estaremos durante muchos años más, de pleno discovery; así, en la infección por Clostridioides difficile, sabemos que el tratamiento con microbiota intestinal funciona, pero no conocemos su mecanismo de acción. Por otra parte, empiezan a ser aceptados por la comunidad científica conceptos como el eje intestino-cerebro y su potencial interacción en el desarrollo de las enfermedades neurodegenerativas, por poner un ejemplo.  

AseBio. Vuestro trabajo se centra en el estudio de la microbiota intestinal. ¿Cuántos tipos existen? 

Juan Basterra. El 90% de los microorganismos que alojamos en nuestro organismo, se encuentra en el intestino, aunque también están descritas la microbiota de la piel, vaginal, incluso la de nuestros pulmones.

AseBio. ¿Qué tipo de aplicaciones tiene la microbiota  en el desarrollo de nuevos fármacos? 

Juan Basterra. La primera generación de medicamentos basados en la microbiota intestinal, como es nuestro caso, está basada en lo que se conoce como full spectrum microbiota y queda un largo camino por recorrer, en cuanto a nuevas aproximaciones como los consorcios bacterianos o, a futuro, los medicamentos customizados en función de la microbiota alterada en diferentes enfermedades.

AseBio. Mikrobiomik aspira a ser la primera compañía mundial que comercialice en la UE el primer medicamento biológico basado en microbiota intestinal en la indicación de recurrencia por ‘Clostridium difficile’, a través de la administración de MBK-01 (4 cápsulas de microbiota fecal liofilizada) en una sola toma. ¿En qué punto os encontráis? 

Juan Basterra. Después de unos resultados intermedios, tanto en eficacia como en seguridad, más que esperanzadores frente al standard-of-care, el antibiótico fidaxomicina en nuestro ensayo clínico fase III, publicaremos los resultados finales en noviembre 2023; en paralelo, hemos realizado la solicitud a la EMA de procedimiento regulatorio centralizado, con el objetivo de solicitar un marketing authorization en la UE y así poder lanzar nuestro primer medicamento biológico en investigación, durante el primer semestre del 2025.  

AseBio. Uno de los aspectos más desconocidos quizás en el caso del microbioma es la posibilidad de ser donante de heces, fundamental no sólo en términos de investigación, sino también a la hora de salvar vidas. ¿Por qué es tan importante la donación? 

Juan Basterra. La donación es nuestra materia prima y, por lo tanto, sin donantes no podríamos salvar vidas. La microbiota intestinal es nuestro principio activo, que encapsulamos en cápsulas gastrorresistentes de 250 mg.

Tenemos que resaltar que todos los donantes sanos validados por Mikrobiomik, lo son después de un riguroso proceso de selección que incluye un cuestionario electrónico, una entrevista médica en profundidad y un conjunto de analíticas en sangre y heces que, se repiten, cuando el donante finaliza su periodo de donación, antes de liberar el lote a producción. Mikrobiomik dispone de la única instalación GMP (Good Manufacturing Practices) a nivel europeo certificada por la AEMPS, para fabricar medicamentos biológicos orales basados en microbiota intestinal.

AseBio. La biotecnología se posiciona como una 'deep tech' que está transformando el mundo a través de tecnologías como el microbioma. ¿Por qué el microbioma ha ganado tanta relevancia en los últimos años? 

Juan Basterra. Por una parte, porque está posicionándose como una alternativa eficaz en algunas enfermedades graves sin tratamiento farmacológico y, por otra, porque puede ser la solución a problemas no resueltos y que pueden derivar, a corto plazo, en un problema grave de salud a nivel mundial, como por ejemplo la multirresistencia bacteriana a los antibióticos.

AseBio. Desde vuestra experiencia, ¿qué potenciales aplicaciones puede tener el microbioma como garante de la salud humana? 

Juan Basterra. El tratamiento del Clostridiodes difficile es tan sólo el primer paso y su eficacia está en torno al 90%, sin efectos secundarios relevantes. Mikrobiomik, como comentamos en la siguiente respuesta, comenzará este año 3 ensayos clínicos adicionales y actualmente hay más de 500 ensayos clínicos en marcha relacionados con la microbiota intestinal, que abarcan desde enfermedades neurodegenerativas hasta cáncer, con especial énfasis en las multirresistencias bacterianas a los antibióticos, próximo reto al que la industria farmacéutica debe aportar, sí o sí, nuevas soluciones y en los que la microbiota se encuentra muy bien posicionada.

AseBio. ¿Cuáles son los retos fijados para MIKROBIOMIK a corto y largo plazo? 

Juan Basterra. A menos de 2 años vista, la comercialización en Europa de nuestro primer medicamento biológico MBK-01 en la infección primaria o recurrente por Clostridioides difficile. En paralelo, comenzaremos este mismo año 3 ensayos clínicos, una fase II en esteatohepatitis no alcohólica, una fase IIa en diverticulitis aguda no complicada y una prueba de concepto en cánceres metastásicos de estómago, páncreas y colon que no responden a 2-3 líneas de tratamiento.

Por otra parte, estamos trabajando en el escalado industrial de nuestra producción con una CDMO británica, con el objetivo de trasladarnos a unas nuevas instalaciones productivas que nos permitan satisfacer la demanda que esperamos del mercado a partir del año 2025.

Estamos en conversaciones con 4 Cias farmacéuticas para licenciar MBK-01 a nivel paneuropeo, ya que la comercialización de nuestros medicamentos biológicos lo haremos a través de un partnership europeo, siendo nuestro foco, la investigación, desarrollo y fabricación. Por último y en base a los datos metagenómicos de nuestros donantes y pacientes, estamos construyendo una plataforma de IA con el objetivo de diseñar medicamentos biológicos customizados basados en la microbiota intestinal.